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| | Nachweis | Kein Nachweis verfügbar |
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| PPARalpha; Chemisches Cross-Linking; Massenspektrometrie; Orbitrap | |
| PPARalpha; Chemical Cross-Linking; Mass Spectrometry; Orbitrap | |
| Chemisches Cross-Linking gefolgt von einer proteolytischen Spaltung und einer anschließenden massenspektrometrischen Analyse der Cross-Linking-Produkte stellt eine alternative Methode dar um niederaufgelöste Proteinstrukturen zu erhalten und um Protein-Protein-Interaktionen zu charakterisieren. Die neuentwickelten MS-spaltbaren Cross-Linking-Reagenzien (”Edman-Reagenz“ ”Thioharnstoff-Reagenz“ und ”Harnstoff-Reagenz“) erlauben es bereits während der Datenaufnahme mit chemischen Cross-Linkern modifizierte jedoch niederabundante Peptide innerhalb einer komplexen Mischung bevorzugt zu fragmentieren. In dieser Arbeit wurde anhand des Modellproteins PPARα gezeigt daß sich die Analytik quervernetzter Peptide mittels datenabhängiger LC/MS-Methoden stark vereinfachen läßt sodaß sich neben bereits automatisierten Methoden der qualitativen und quantitativen Proteomik auch automatisierte Methoden der strukturellen Proteomik etablieren werden. |
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