Elektronische Hochschulschriften / Usability of nuclear single-copy genes compared with plastid DNA on different phylogenetic levels of and within the order Poales

Titelaufnahme

Titel	Usability of nuclear single-copy genes compared with plastid DNA on different phylogenetic levels of and within the order Poales : [kumulative Dissertation] / vorgelegt von Anne Hochbach
Verfasser	Hochbach, Anne
Gutachter	Röser, Martin ; Blattner, Frank ; Braun, Uwe
Körperschaft	Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg
Erschienen	Halle, 2019
Umfang	1 Online-Ressource (66 Seiten)
Hochschulschrift	Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Dissertation, 2019
Anmerkung	Tag der Verteidigung: 29.01.2019
Sprache	Englisch
Dokumenttyp	E-Book
Schlagwörter	Phylogenie / Gräser / Chloroplast / Sequenzanalyse
Schlagwörter (GND)	Halle (Saale)
URN	urn:nbn:de:gbv:3:4-24287

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Usability of nuclear single-copy genes compared with plastid DNA on different phylogenetic levels of and within the order Poales [0.54 mb]

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Keywords
MatK; Phylogenie; PhyB; Poaceae; Poales; Pooideae; Restiid; single-copy Kerngen; Topo6
Keywords (Englisch)
matK; nuclear single-copy gene; phylogeny; phyB; Poaceae; Poales; Pooideae; restiid; topo6
Keywords
Diese Arbeit untersucht die phylogenetische Systematik auf Ordnungsebene (Poales) Clade-Ebene (restiids) Familienebene (Bromeliceae und Poaceae) und Unterfamilienebene (Pooideae) um offene Fragen zu beantworten. Dazu wurden Stammbäume aus DNA-Sequenzen des Chloroplasten (matK-psbA) mit denen verschiedener single-copy Kerngene (Topo6 PhyB Acc1) verglichen und die Verwendbarkeit der Marker getestet. Innerhalb der Poales konnten die Kerndaten keine neuen Erkenntnisse bringen. Die Daten unterstützen zwei Familien (Anarthriaceae Restionaceae) innerhalb des restiid-Clades und die centrolepids als Unterfamilie Centrolepidoideae. Topo6 zeigt alle Großgruppen der Gräser monophyletisch. Der kombinierte Kerndatensatz unterstützt innerhalb der Pooideae alle anerkannten Triben und Subtiben. Verschiedene Klonsequenzen von Ampelodesmos (Acc1 Topo6) weisen auf einen hybridogenen Ursprung dieser monotypischen Gattung hin mit Eltern in den Stipeae und den Duthieeae. Insgesamt erwiesen sich alle genutzten Abschnitte der single-copy Kerngene als geeignet für die phylogenetischen Untersuchungen.
Keywords
This thesis investigates the phylogenetic systematics at the ordinal level (Poales) clade level (restiids) familial level (Bromeliaceae and Poaceae) and subfamilial level Pooideae with the aim to answer questions that have as of yet been unresolved. A plastid reference tree (matkpsbA) was compared with nuclear single-copy gene trees (Topo6 PhyB Acc1). Within the Poales the nuclear data could not bring any new insights. The data support two families within the restiid clade (Anarthriaceae Restionaceae) and the centrolepids as subfamily Centrolepidoideae. Topo6 show the monophyly of all major groups of grasses. All established tribes and subtribes of the Pooideae are supported by the combined nuclear dataset. Different clone types of Ampelodesmos (Acc1 Topo6) suggests a hybrid origin of this monotypic genus with a potential ancestor within the Stipeae and the Duthieeae. The used Marker regions of the nuclear sinlge-copy genes were altogether suitable for the phylogenetic investigations.