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Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt

Elektronische Hochschulschriften
Titelaufnahme
Titel Analyse und Visualisierung von Experimentdaten im Kontext biologischer Netzwerke / von Christian Klukas
Verfasser Klukas, Christian
Erschienen 2009
Umfang Online-Ressource (II, 100, III S. = 14,95 mb) : graph. Darst.
Sprache Deutsch
Anmerkung Tag der Verteidigung: 08.10.2009
Hochschulschrift Halle, Univ., Naturwissenschaftliche Fakultät III, Diss., 2009
URN urn:nbn:de:gbv:3:4-1412 
Gutachter  Schreiber, Falk Prof. Dr.
  Hofestädt, Ralf Prof. Dr.
Schlagwort Online-Publikation / Hochschulschrift
Klassifikation
Informatik, Informations- wissenschaft, allgemeine Werke → Informatik, Wissen, Systeme → Datenverarbeitung; Informatik
 
Abstract
Die vorliegende Arbeit stellt zu Beginn relevante Grundlagen zu Biologie, Statistik und Informatik vor. Darauf aufbauend wird eine Methodik entwickelt, welche es ermöglicht, komplex strukturierte Experimentdatensätze aus verschiedenen omics-Bereichen in einem einzigen Datenmodell abzubilden. Das Konzept des Mappinggraphen erlaubt die flexible Definition unterschiedlicher biologischer Netzwerke und Klassifikationssysteme. Die Zuordnung von relevanten Teilen des Experimentdatensatzes zu Knoten und Kanten des Mappinggraphen erfolgt durch das Datenmapping. Zur dynamischen Visualisierung notwendige Interaktionsmethoden, zum Beispiel für die Integration von verschiedenen Pathways und andere Navigationsmethoden, sind ein weiterer wichtiger Bestandteil der vorgestellten Methodik. Integrierte Daten, also biologische Netzwerke, Klassifikationssysteme und Experimentdaten, können in VANTED, welches die vorgestellte Methodik vollständig umsetzt, vielfältig interaktiv visualisiert und analysiert werden.
 
Abstract (englisch)
Starting with a description of the basics of biology, statistics and computer science, this work introduces a newly developed methodology. It is compromised of a method to store and process complex-structured experiment data and a mapping graph data model for biological networks or classification hierarchies. Through a process called data mapping, experiment data is assigned to elements of a target mapping graph (nodes or edges). In order to support dynamic visualisation, important user interaction techniques are adapted or newly developed for this field of application, for example methods for the integration of multiple pathways. Using the software application VANTED, which implements all of the presented methods, network-integrated experiment data may be visualised and analysed in a flexible way.
 
Keywords
Visualisierung Datenanalyse Bioinformatik Graphen Statistik
 
Keywords (englisch)
visualisation data analysis bioinformatics graphs statistics.