Titelaufnahme

Titel
Predicting DNA binding sites using generative, discriminative, and hybrid learning principles / von Jens Keilwagen
VerfasserKeilwagen, Jens
BetreuerGrosse, Ivo Prof. Dr. ; Rätsch, Gunnar Dr.
Erschienen2010 ; Halle, Saale : Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt, 2010
UmfangOnline-Ressource (131 S. = 4,68 mb) : graph. Darst.
HochschulschriftHalle, Univ., Naturwissenschaftliche Fakultät III, Diss., 2010
Anmerkung
Tag der Verteidigung: 08.07.2010
Sprache der Zusammenfassung: Deutsch
SpracheEnglisch
DokumenttypE-Book
SchlagwörterBioinformatik / Maschinelles Lernen / Halle
URNurn:nbn:de:gbv:3:4-3105 
Zugriffsbeschränkung
 Das Dokument ist frei verfügbar.
Dateien
Predicting DNA binding sites using generative, discriminative, and hybrid learning principles [4.68 mb]
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Nachweis
Keywords
Bioinformatik; maschinelles Lernen; probabilistische Modelle; Parameterschätzung; Lernprinzip; Bindungsstelle; Spleißstelle;Transkriptionstartstelle; Datenbankkuration; de-novo Motiverkennung
Keywords (Englisch)
computational biology; machine learning; probabilistic models; parameter estimation; learning principle; binding site; splice site; transcription start site; database curation; de-novo motif discovery
Keywords
In den vergangenen Jahren haben neue Hochdurchsatz-Technologien und die Entwicklung neuer bioinformatischer Methoden für die Vorhersage von kurzen Signalsequenzen viele neue Erkenntnisse und Hypothesen für die Genregulation vorgelegt. Trotz des überwältigenden wissenschaftlichen Fortschritts der letzten Jahre sind viele Aspekte wie die zelluläre Maschinerie diese kurzen Sequenzen mit hoher Genauigkeit erkennt und bindet immer noch nicht vollständig verstanden. In dieser Arbeit wurde ein formaler Ansatz für das Lernen probabilistischer Modelle aus der Familie der Markov Random Fields präsentieren der eine Interpolation zwischen mehreren etablierten Lernprinzipien einschließlich generativen diskriminativen hybriden Bayes'schen und nicht-Bayes'schen Lernprinzipien ermöglicht. Es konnte gezeigt werden dass diese Modelle und Lernprinzipien bei der Spleißstellen-Erkennung Transkriptionsstartstellen-Erkennung Datenbankkuration und de-novo Motiverkennung vergleichbare oder bessere Güten im Vergleich zu anderen aktuellen Ansätzen liefern.