Titelaufnahme

Titel
Bioinformatics approach for microRNA target prediction and functional analysis / von Emmanouil Maragkakis
VerfasserMaragkakis, Emmanouil
BetreuerGrosse, Ivo Prof. Dr. ; Hatzigeorgiou, Artemis Dr. ; Makalowski, Wojciech Prof. Dr.
Erschienen2011 ; Halle, Saale : Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt, 2011
UmfangOnline-Ressource (127 Bl. = 14,99 mb)
HochschulschriftHalle, Univ., Naturwissenschaftliche Fakultät III, Diss., 2011
Anmerkung
Tag der Verteidigung: 08.07.2011
Sprache der Zusammenfassung: Deutsch
SpracheEnglisch
DokumenttypE-Book
SchlagwörtermiRNS / Bioinformatik / Halle
URNurn:nbn:de:gbv:3:4-5850 
Zugriffsbeschränkung
 Das Dokument ist frei verfügbar.
Dateien
Bioinformatics approach for microRNA target prediction and functional analysis [14.99 mb]
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Nachweis
Keywords
Vorhersage von MiRNA-Ziel-Interaktionen; Funktionsaufklärung von miRNAs; Web-Server; viraler MiRNA; next generation sequencing; PAR-CLIP; differentiellen Genexpression; Signalwege
Keywords (Englisch)
microRNA target prediction; microRNA function; Web server; viral microRNA; next generation sequencing; PAR-CLIP; differential expression; biological pathways
Keywords
MikroRNAs sind kleine endogene RNA-Moleküle die eine Schlüsselrolle in der Zellentwicklung und in verschiedenen Krankheiten durch post-transkriptionelle Regulation der Genexpression spielen. In dieser Arbeit wurde die Vorhersage von MikroRNA-Ziel-Interaktionen durch die Entwicklung zweier verschiedener Varianten des DIANA-microT-Programms und eines neuartigen auf probabilistischen Modellen basierenden Alignment-Algorithmus behandelt. Es wurden durch eine Kombination aus experimentellen und computergestützten Methoden virale MikroRNA-Ziel-Interaktionen mit Genen des Wirtes des Virus analysiert. Weiterhin wurde die Funktion von mikroRNAs durch die Entwicklung eines Programms zur Identifikation von mikroRNAs die an der differentiellen Expression von Genen beteiligt sind sowie eines Programms zur Beurteilung der Wirkung von mikroRNAs in Signalwegen untersucht. Ein Web-Server zur Funktionsaufklärung von mikroRNAs wurde entwickelt.