Das Protein SUVH2 ist ein SET-Domänen Protein aus Arabidopsis. Es enthält eine N terminale YDG- Domäne und eine C terminale SET- Domäne. Die SET-Domäne wurde in verschiedenen Proteinen aus zahlreichen Organismen identifiziert. Für das Arabidopsis Protein SUVH2 konnte eine Histon Methyltransferase Aktivität (HMTase) für H3K9, H3K27 und H4K20 gezeigt werden. Das Protein SUVH2 liegt im Kern vor und wird in verschiedenen Organen transkripiert. Für weitere Analysen von SUVH2 wurden transgene Linien in sense und antisense Orientierung hergestellt. Durch die Überexpression von SUVH2 in den Linien 35S*::mycSUVH2#5, #6 und #22 kommt es zur Ausprägung eines "mini" Pflanzen Phänotyps. Die Keimlinge dieser Überexpressionslinien zeigen curled Kotyledonen und Rosettenblätter. Des weiteren weisen sie ein geringeres Wachstum als der Wildtyp Arabidopsis thaliana columbia auf. In diesen Linien 35S*::mycSUVH2 erfolgt eine genomweite Änderung der Genexpression, dies konnte anhand einiger mobilen Elemente (Athila, T1) und Genen der Pathogenabwehr (PR1, RPP5) gezeigt werden. Zwischen der HMTase SUVH2, der DNA Methyltransferase MET1 und dem DNA Remodellingfaktor DDM1 wurde eine Interaktion gezeigt. SUVH2 hat einen Einfluss auf die Expression von Transgenen. So wurde in den Überexpressionslinien 35S*::mycSUVH2 eine verstärkte Inaktivierung des Transgens LUZIFERASE nachgewiesen. In der Nullmutante suvh2 erfolgte eine Aktivierung der LUZIFERASE. In mit der Turnip Mosaik Virus (TuMV) infizierten Wildtyppflanzen konnte ein erhöhte Expression von SUVH2 nachgewiesen werden. In der Nullmutante suvh2 wird diese durch SUVH4 kompensiert. Durch viralen Stress erfolgt eine Änderung der Histon- modifikationen und möglicherweise auch eine Änderung der DNA-Methylierung.
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