Titelaufnahme

Titel
Microsatellites - powerful tools for genome mapping and genome evolution : a case study on the insect Bombus terrestris and other social Hymenoptera / von Eckart Stolle
VerfasserStolle, Eckart
BetreuerMoritz, Robin F. A. Prof. Dr. Dr. ; Rüppell, Olav Prof. Dr. ; Webster, Matthew Prof. Dr.
Erschienen2013 ; Halle, Saale : Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt, 2013
UmfangOnline-Ressource (56 Bl. = 1,41 mb)
HochschulschriftHalle, Univ., Naturwissenschaftliche Fakultät I, Diss., 2013
Anmerkung
Tag der Verteidigung: 29.07.2013
Sprache der Zusammenfassung: Deutsch
SpracheEnglisch
DokumenttypE-Book
SchlagwörterHalle
URNurn:nbn:de:gbv:3:4-10725 
Zugriffsbeschränkung
 Das Dokument ist frei verfügbar.
Dateien
Microsatellites - powerful tools for genome mapping and genome evolution [1.4 mb]
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Nachweis
Keywords
Bombus terrestris; Mikrosatelliten; Genomevolution; Microsatelliten Konservierung; Generationszeiteffekt; next generation sequencing; SNP Genotypisierung; genetische Kartierung; Rekombinationsrate; soziale Hymenopteren
Keywords (Englisch)
Bombus terrestris; microsatellites; genome evolution; microsatellite conservation; generation time effect; next generation sequencing; SNP genotyping; genetic mapping; recombination rate; social Hymenoptera
Keywords
Die vorliegende Arbeit beschäftigt sich mit DNA Elementen die häufig und in ihrer Länge variabel in den meisten Genomen vorkommen den Mikrosatelliten. Im ersten Teil der Arbeit werden neue Mikrosatelliten Loci für die Erdhummel Bombus terrestris charakterisiert um in dieser und anderen Hummelarten genutzt zu werden. Im zweiten Teil werden diese und weitere Mikrosatelliten benutzt um das Genom der Erdhummel zu kartieren. Es konnte eine saturierte genetische Karte für die 16 Kopplungsgruppen (Chromosomen) erstellt werden die als Basis für Genkartierung Genom-Assemblierung und für den Vergleich von Rekombinationsraten dient. In einer weiteren Studie wurde die evolutionäre Dynamik von Mikrosatelliten in Dipteren und Hymenopteren untersucht und verglichen wodurch eine schnellere Genomevolution in letzteren ersichtlich wurde. Im letzten Teil wird eine neue Methode vorgestellt die auf kleinen Next-Generation-Sequencing Plattformen SNPs Genotypisierung erlaubt.
Keywords
The presented thesis has its focus on common and in their length length variable DNA elements which are present in most genomes: the microsatellites. In the first part of the thesis novel microsatellite loci for the buff-tailed bumblebee Bombus terrestris are developed and characterized to be available for this and other bumblebee species. In the second part these and further microsatellites are used to map the genome of the buff-tailed bumblebee. It was possible to saturated the genetic map and detect all 16 expected linkage groups (chromosomes) which can serve as a basis for gene mapping genome assembly and the comparison of recombination rates. In the next study the evolutionary dynamics of microsatellites was investigated in Diptera and Hymenoptera. This showed a faster rate of genome evolution in the latter. In the last part a novel method for genotyping by sequencing on small scale next generation sequencing platform is presented.