Die Genexpression hängt zu einem großen Teil von der zellulären Konzentration der mRNA ab, die wiederum von dem Verhältnis zwischen Transkription und Abbau bestimmt wird. Ein allgemeiner Weg des mRNA-Abbaus in Hefe und in höheren Eukaryonten wird durch eine allmähliche Verkürzung des Poly(A)-Schwanzes eingeleitet. Die Deadenylierung ist ein relativ langsamer Proezss und wahrscheinlich geschwindigkeitsbestimmend für den mRNA-Abbau. Die poly(A)-spezifische Ribonuclease (PARN) ist eine 3'-5'-Exoribonuklease, die aus Kalbsthymus, HeLa-Zellen und Xenopus laevis gereinigt worden ist und vermutlich an der Deadenylierung der mRNA beteiligt ist. Diese Arbeit zeigt, daß die Deadenylierung in Extrakten aus HeLa-Zellen oder durch die gereinigte PARN durch ein m7GpppG-cap am RNA-Substrat stimuliert wird. PARN selber ist ein cap-bindendes Protein, was durch seine Fähigkeit, an m7GTP-Sepharose zu binden, gezeigt wurde. Die menschliche PARN wurde in HEK293-Zellen transient exprimiert und zur Homogenität gereinigt. Dieses Enyzme baute die Poly(A)-Schwänze von RNA mit einem m7GpppG-cap auf prozessive Weise ab, während RNA mit einem unmethylierten cap auf distributive Weise abgebaut wurde. Möglicherweise induziert die Bindung von PARN an das cap eine Konformationsänderung des Enzyms. Die Zugänglichkeit des 5'-cap könnte durch den Status des Translationsinitiations-Komplexes beeinflußt werden, der unter anderem aus dem cap-bindenden Protein eIF4E, eIF4G und dem Poly(A)-Bindungsprotein PABPC besteht. PARN wurde durch eIF4E nicht beeinflußt, aber durch eIF4G gehemmt. Eine Wechselwirkung zwischen PARN und der mittleren Domäne von eIF4G wurde aufgrund von GST- und m7GTP-pulldown-Experimenten vermutet. Das native Molekulargewicht von PARN wurde als 150 kDa bestimmt, während die monomere Masse 74 kDa beträgt. PARN scheint also als Homodimer zu existieren.
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